Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms