Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncaipQ99ME3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms