Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms