Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rcbtb2Q99LJ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rcbtb2Q99LJ7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms