Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnpo2Q99LG2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms