Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PpifQ99KR7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms