Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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