Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Higd1bQ99JY6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms