Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ophn1Q99J31 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms