Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mcoln1Q99J21 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcoln1Q99J21 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms