Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ctu1Q99J10 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctu1Q99J10 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms