Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csmd1Q923L3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csmd1Q923L3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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