Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf3Q922U1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf3Q922U1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms