Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb6Q922F4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubb6Q922F4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms