Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mthfd1Q922D8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mthfd1Q922D8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms