Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pde6cQ91ZQ1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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