Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims2Q91XD2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms