Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx15Q91WE1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx15Q91WE1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms