Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csde1Q91W50 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms