Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApofQ91V80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms