Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem30aQ8VEK0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms