Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul7Q8VE73 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms