Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39cQ8VE09 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ttc39cQ8VE09 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ttc39cQ8VE09 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Ttc39cQ8VE09 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ttc39cQ8VE09 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttc39cQ8VE09 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttc39cQ8VE09 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc39cQ8VE09 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ttc39cQ8VE09 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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