Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc6a20aQ8VDB9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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