Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rdh10Q8VCH7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rdh10Q8VCH7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rdh10Q8VCH7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rdh10Q8VCH7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rdh10Q8VCH7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rdh10Q8VCH7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rdh10Q8VCH7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rdh10Q8VCH7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Rdh10Q8VCH7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh10Q8VCH7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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