Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmx1Q8VBT0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmx1Q8VBT0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmx1Q8VBT0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmx1Q8VBT0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmx1Q8VBT0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmx1Q8VBT0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmx1Q8VBT0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmx1Q8VBT0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmx1Q8VBT0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms