Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpm8Q8R4D5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms