Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnaaf4Q8R368 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf4Q8R368 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf4Q8R368 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf4Q8R368 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf4Q8R368 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf4Q8R368 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf4Q8R368 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf4Q8R368 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnaaf4Q8R368 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms