Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms