Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms