Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4S1

Plce1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 2,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plce1Q8K4S1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Plce1Q8K4S1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Plce1Q8K4S1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Plce1Q8K4S1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Plce1Q8K4S1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Plce1Q8K4S1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Plce1Q8K4S1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Plce1Q8K4S1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Plce1Q8K4S1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plce1Q8K4S1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms