Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defb12Q8K4N3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defb12Q8K4N3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms