Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MyripQ8K3I4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MyripQ8K3I4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms