Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prpf39Q8K2Z2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf39Q8K2Z2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms