Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Mtmr3Q8K296 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mtmr3Q8K296 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtmr3Q8K296 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtmr3Q8K296 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtmr3Q8K296 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtmr3Q8K296 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtmr3Q8K296 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtmr3Q8K296 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtmr3Q8K296 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtmr3Q8K296 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtmr3Q8K296 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Mtmr3Q8K296 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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