Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fcho1Q8K285 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fcho1Q8K285 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fcho1Q8K285 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fcho1Q8K285 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fcho1Q8K285 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fcho1Q8K285 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcho1Q8K285 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms