Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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