Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pkn3Q8K045 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms