Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp1Q8K021 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scamp1Q8K021 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms