Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d5Q8JZW5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d5Q8JZW5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms