Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Znf628Q8CJ78 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf628Q8CJ78 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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