Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms