Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms