Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip4Q8CI96 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clip4Q8CI96 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clip4Q8CI96 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clip4Q8CI96 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms