Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS8

Vps37a, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37aQ8CHS8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps37aQ8CHS8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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