Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap29Q8CGF1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms