Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc73Q8CDM4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms