Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF3

Gm10295, Predicted gene 10295, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10295Q8CCF3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm10295Q8CCF3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm10295Q8CCF3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10295Q8CCF3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10295Q8CCF3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10295Q8CCF3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10295Q8CCF3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10295Q8CCF3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10295Q8CCF3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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