Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms