Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB49

Tprg1, Tumor protein p63-regulated gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tprg1Q8CB49 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tprg1Q8CB49 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms